醫院各部門的功能、設施和人員組成情況不同，產生污水的主要部門和設施有：診療室、化驗室、病房、洗衣房、X光照像洗印、動物房、同位素診斷、手術室等排水。醫院行政管理和醫務人員排放的生活污水，食堂、單身宿舍、家屬宿舍排水。不同部門科室產生的污水成分和水量各不相同，如重金屬廢水、含油廢水、洗印廢水、放射性廢水等。而且不同性質醫院產生的污水也有很大不同。醫院污水較一般生活污水排放情況復雜。
鄉鎮衛生院污水處理設備的選擇方案原則：在篩選多種治理方案的前提下，合理選定設計方案，減少工程造價，減少建設投資，減少運行費用，主體工藝路線盡量采用自流方式，減少動力消耗，節約能源；本著切合實際，經濟合理，安全適用的原則，采用成熟的工藝，增加工藝含量，完善節能措施。
鄉鎮衛生院污水處理設備工藝的具體思路如下：
①預處理：
首先通過格柵攔截，主要作用是去除污水中較大的懸浮或漂浮物，以減輕后續水處理工藝的處理負荷，并起到保護水泵、管道、儀表等作用。接著由提升泵定量提升至調節池進行水質水量的調節。
②二級處理：
經調節后的污水通過生物接觸氧化法及MBR進行二級處理。
在生化處理系統中利用生物膜的作用使有機污染物首先轉化為氨氮，同時通過好氧硝化和缺氧反硝化過程既去除有機物又去除了氨氮。生化池配以新型的高密型彈性立體填料，該填料具有負荷高、施工簡易、體積小、運行穩定可靠、管理方便、維修更換方便等優點。
污水經生化處理后進入MBR膜池進行固液分離，污泥部分經污泥回流進入缺氧池進行脫氮除磷，上清液經溢流流入中間水池。
③消毒處理
污水進入消毒池，進行消毒處理，經消毒處理后能確保污水經處理后各項指標全部達標。
④污泥處理
沉淀池污泥回流后的剩余污泥經簡單的濃縮消化，然后定期外運。
